胃腸炎でしょうか？それともインフル？

10歳未満/女性 - 2016/03/08

4歳女児です。

今日の夜中2時過ぎに熱（38.8度）に気が付く。
その時、起きてトイレにて下痢。

翌日朝は、熱から昼前までは38
度前後。比較的元気。食欲はない。

昼前に昼寝をしてきたら、熱が39度に上がる。比較的元気。食欲はない。

幼稚園で、インフルＡ、インフルＢ、胃腸炎、ロタウイルスが流行り、今日から2日間休園。

インフルＢだと思い（インフルＡはしたので）検査の為昼から受診。（熱が出てから12時間経過）
インフルは陰性。
胃腸炎とのことで、ビオフェルミンのみもらい帰宅。

帰宅してから熱が37.5度まで下がったり元気でしたが、6時過ぎから39度まで上がる。

熱が上がったり、下がったり激しくて心配です。

インフルの検査が早くて陽性がでなかったんでしょうか？
それともやはり胃腸炎なんでしょうか？