尿が少なく、排尿時痛? 至急お願いします。

乳幼児/男性 - 2011/07/05

1歳8ヶ月男児です。
金曜の夕方より38度台の熱があり、土日も昼間は微熱ですが、夕方〜夜になると、38度台の熱がありました。
月曜に病院に行ったのですが、熱のほかに風邪らしい症状がないということで、腎盂腎炎をうたがい、尿検査をし、結果が微妙だったということで、再度膀胱に管?を入れて直接尿をとる検査と、血液検査をしました。
が、結果として腎盂腎炎ではないということになりました。
火曜の今日も午前中からさらに熱が上がったので再度病院に行ったら、今日はのどのはれがひどかったらしくアデノウィルスの検査をしたら、アデノウィルスに感染していることがわかり、ひとまず発熱の原因がわかってほっとしたのですが・・・

きのうの18時頃から今日の15時頃までの間に、尿が2回しか出ておらず、ふだんよりずっと少ないと思います。
午前中の時点で小児科の先生には話したのですが、朝出たのであれば、大丈夫だろうと言われました。
あと、言葉で伝えられないのでわからないのですが、ときどきおちんちんのあたりをさわって痛そうにしています。
月曜の尿検査ですこし傷ができている、というようなことでしょうか。
それとも、ほかの原因があるでしょうか。
きのう今日で病院ばかりにいて子どもも疲れているので様子を見ていようと思いつつ、大丈夫か心配しています。
アドバイスをお願いします。