抗生物質について

2歳3か月の双子(仮にAとBとします)がおります。
Aが20日ほど前に鼻水、咳が出始め、38度程度の熱がでたのでかかりつけ医に行ったところ、オゼックスの他、アスベリンやムコダインなどが処方されました。熱はすぐ下がり、鼻水もまもなくなくなり、現在、まだ咳だけが出ています。
もう一人BはAからうつったようで10日ほど前に39.6度の発熱。休日だったため、かかりつけ医ではない休日当番医に行き、ジスロマックを処方されました。熱はすぐ下がり、やはり咳だけが続いていたため、その後、かかりつけ医に行くとAと同じオゼックスを処方されました。Bはようやく良くなり、現在は咳も出なくなりました。
咳が長く続いているということで血液検査をうけたところ、二人ともマイコプラズマではなく、クラミジア気管支炎と言われました。そしてオゼックスが効かなかったことなどから、ミノマイシンを処方されました。10日間は飲み続けなければいけないと言われました。ミノマイシンの副作用についても説明もありましたが、長く飲むわけではないから大丈夫と言われました。
しかし、ミノマイシンについて調べると本当に大丈夫なのか、だんだん不安になってきました。Bがジスロマック→オゼックスで治ったので、Aもジスロマックを試してみたらどうなのだろうかと素人ながら思っていますが、どうなのでしょうか?
また、ミノマイシンを10日間飲み続けることは長期とはいわないのでしょうか?
長文になってすみません。どうぞよろしくお願いします。

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