下痢と発熱 抗生剤について

乳幼児/男性 - 2012/12/14

いつもお世話になっております。
2歳の子が数日前からやや軟便になり、一昨日は水様便が5回になり、食欲もなくなり、39℃の熱も出たため小児科受診しました。
オラスポア小児用ドライシロップ、ビオフェルミンR散を処方されました。
薬を非常に嫌がるのですが、なんとか抗生剤は2回、飲ませ、熱は37℃台に下がってきています。
下痢は、食べていないため、おむつに茶色の汁のようについています。
まだ、しばらくは、がんばって飲ませる予定ですが、解熱したり、症状が改善しても薬は飲ませたほうが良いですか?
それぞれ、4日分出ています。
抗生剤は途中で止めるのは良くないと聞いたことがありますがどうですか?
また、途中で止めると何故良くないのでしょうか?
耐性菌ができるようなことは聞いたことがありますが、抗生剤はどれも、途中で止めるのは良くないのでしょうか?

また、1日三回の処方ですが、寝てしまい、1日三回きちんと飲めない時もありますが、これも良くないですか?

ご多忙のところ、申し訳ありませんが、ご教授お願いいたします。