薬の飲み合わせについて教えてください

乳幼児/男性 - 2013/02/22

3才です。3日前に熱が出て、クラリシッドドライシロップとアスベリン、アリメジン、ムコアストマリ内用薬の混合された薬を1日3回飲ませています。ホクナリンテープも処方されました。熱はすぐ下がりましたがまだ飲ませていました。昨晩からまた熱が出、咳もひどくなってきたので、今朝、薬を飲ませず病院へ行きました。先月肺炎になったのと喘息の疑いもあり今日、ミノマイシンとシングレアを処方されました。クラリシッドドライシロップをやめてミノマイシンに変更するよう言われました。今朝、クラリシッドドライシロップを飲ませていないことを伝えると、帰宅後、ミノマイシン1回目を飲ませて、夜に2回目を飲ませるように指示をもらいました。
薬局で薬剤師さんに、ミノマイシンは夜から飲んでくださいと言われました。「朝クラリシッドドライシロップを飲ませてないので、ミノマイシンを昼から飲ませていいと医師に言われました。」と伝えると、「そうですか～医師がそういうのならそれでもいいと思いますけど…」とかなり曖昧に答えられてしまいました。帰宅後、医師の指示通り、1日2回のミノマイシンを1回目12時頃に飲みました。2回目を21時頃に飲ませるつもりでいますが、薬剤師さんの言葉がモヤモヤして不安です。
昨日の夜までクラリシッドドライシロップを飲んでいたので、今日の夜までミノマイシンを飲ませない方が良かったのでしょうか?もし飲ませない方が良かったとしたら、2回目は飲ませない方がいいですか?
本人は咳は残っていますが、熱も下がり、今は熟睡しています。