歯根が固く腫れて来ました

30代/女性 - 2013/03/24

昨年10月頃から、前歯のはぐき、右上1.2番の間あたりが腫れていましたが、レントゲンの結果異常がないとのことで、他の歯の治療が優先されました。1.2番はいずれも差し歯で神経はありません。
ただ痛みや違和感が取れないので、医師に相談したところ、中をキレイにするとのことで、根っ子の掃除をしました。1番から膿が出てきたので薬を入れました。２回目の掃除のときは膿はもう出ていないとのことでしたが、以前の治療で歯根をツンツンし過ぎたせいで歯根に穴が空いているから、穴をふさぐ薬を入れたとのことでした。顕微鏡での診断でCTなどは撮っていません。
その数日後、これまでなんともなかった歯根の上の方(鼻のした辺り）が丸く固く腫れて来ました。
骨のように固く腫れています。心配ですぐ歯医者に行ったら、大学病院を紹介され、歯根を取ってきて欲しいとのこと。
いったい、薬を入れて何がどうして、硬いしこりができるのでしょうか？
根っ子の中はキレイになっているそうです。
またしこりは、根の治療で２回目に薬を入れた後から出てきました。
長くなりましたが、歯根に何が起こったのでしょうか？