風邪の治りかけなのですが

乳幼児/女性 - 2013/08/27

2歳半の女の子です
8月18日夕方に40度の熱が急に出ました。火曜日39度前後だったので病院に行きました。そのときは夏風邪でしょうと診断を受け痰を出す為のシロップと抗生物質を貰いましたが夜また熱が上がった為、解熱剤を貰いに夜間救急に行きました。解熱剤は苦くて飲んでくれませんでした。水曜日は下がりましたが木曜日にまた熱が上がり咳込み寝にくそうだったのでまた夜間救急に行き、咳止めシールと座薬を貰いました。明日も熱が下がらないようだったら…と言われ金曜日も熱が下がらなかったので昼間受診しました。
肺炎になってないかどうかレントゲンと血液検査、点滴をしました。やはりウイルス性ではありましたが肺炎にもなっておらず気管支炎になる手前くらいだったということで薬はマイコプラズマにも効く薬と変わらずムコダインシロップでした。
お陰で熱も平熱に戻りましたが、咳がたまに出ます。睡眠時に咳が出るのは寝入り端の時くらいであとは普通に生活してるときに出るくらいです。マイコプラズマに効くという抗生物質は苦すぎてアイスに混ぜてもゼリーに混ぜても飲めません。シロップはまだ飲ませてます、
やはり抗生物質は飲ませないといけないでしょうか
そして昨日からちょっとウンチが濃い緑色の軟便です。朝方もオムツにウンチをしていました。これは薬や風邪が治りかけのウンチなのでしょうか??咳もいつまで続いたら受診したほうがいいのでしょうか?
回答よろしくお願いします。