予防接種について。

20代/女性 - 2013/12/25

長女4才が アデノウイルスによる 結膜炎と診断されました。インフルエンザの予防接種の2回目を予定していたのですが 熱が下がって2週間はあけないと予防接種できないと言われました。2週間もあけると一回目から 4週間を大幅に越えてしまいます。それでも免疫は着きますか？
また2週間以内に接種すると どうしていけないのか教えてください。
もしかしたら長男がアデノウイルスだったかもしれないのにインフルエンザの予防接種の2回目を接種してしまいました。
無知でごめんなさい。