不正出血か生理か判断できず困っています

30代/女性 - 2014/04/26

PCOと診断されクロミッドを飲んでいましたが、ここ3ヶ月間は治療をお休みしていました。
今月からまたクロミッドを飲むため、薬を処方されていますが、3日前から不正出血（茶色のおりもの）が出ており、これは生理なのかわからずクロミッドを飲んでいいものか困っています。
約2週間前に排卵期特有のおりものが出たのですが、基礎体温の高温期はいつもより低めでした。
PCOなのでそもそも自然排卵で来ていなかったのでしょうか。無排卵だった場合はこのまま待っていれば生理は来るのでしょうか？
因みに子宮頚癌と子宮体癌の検査を先月行いましたが陰性でした。
恐れいりますが、ご教示よろしくお願いします。