39〜40度の高熱が5日以上続いています。

乳幼児/男性 - 2014/06/21

1日目、39度の発熱と嘔吐、腹痛のため夜間救急へ行きました。胃腸炎の可能性が高いとのことでミヤBMとアンヒバ座薬をもらい帰宅。
2日目、39〜40度を超える高熱と嘔吐2回。自力で歩けない状態。かかりつけの小児科へ行くと、便秘かもしれないとのことで浣腸。便秘が原因の嘔吐かもしれないがこんなに高熱は出ないと思うとのこと。
夜、熱性痙攣のため、救急へ。点滴と痙攣用の座薬をさして帰宅。
3日目。変わらず40度。嘔吐なし。ぐったりしていて自力で歩けない。話しかけてもぼーっとして返事なし。
いつも救急で受診している総合病院へいき、熱を下げるために入院。胸部レントゲン、血液検査の結果からウイルス性咽頭炎と診断。少し喉が赤いとのこと。
4日目。日中38度台後半に。少し歩けるようになったが、夕方からは40度超え。
5日目。日中38度台。再度レントゲンと血液検査をするが、異常なし。夕方から40度超え。夜中座薬をして37度台に。
6日目(本日)。日中38度台。4日目から便なし。

いつも活発で元気な子で、インフルエンザでもこんなに高熱は続きませんでした。ぐったりして声も小さくて、疲れた顔をしていて可哀想です。ご飯もちょっとしか食べず、お菓子を少し食べています。点滴は水分のみで、担当医師は、細菌性ではないので抗生剤は効かないとの一点張りです。他に治療法や、検査するべきものはないのでしょうか？咽頭炎と言いますが喉は痛がっていません。

母親である私は産後のため実家にいて、父親がずっと付き添いしています。私が入院中寂しい思いをさせ、その間に高熱で入院してしまい更につらい思いをさせて、子供が家に帰りたいと泣いているのが可哀想で仕方ありません。

高熱はこんなに続くものなのでしょうか？他の病気の可能性やアドバイス等、どうか教えてください。