免疫機能の病気かどうか知りたいです

30代/女性 - 2015/10/26

約2週間前に発熱し、38〜40度で一週間発熱が続き、やっと一日中発熱しなかったと思ったら、また発熱40.1度まであがりました。このときは咳もひどくRSと診断され、通院しておりましたが、よくならず、市立病院に紹介され、肺炎気味ということで、現在入院しています。
発熱してから1週間になりますが、まだ熱が下がらず、下痢が4日間続いています。担当の先生から、免疫機能の検査をするので、2.3日後に結果をお伝えしますと言われました。

最初に発熱してから2週間経過し、RSの診断、そして続く下痢、免疫機能に障害でもあるのでしょうか？
先々月手足口病になったときも、発疹はすくなかったのですが、発熱は5日間くらいありました。
なにか大きい病気でしょうか？