赤ちゃんの大腸菌と予防接種について

30代/女性 - 2016/07/07

4ヶ月の赤ちゃんです。先月便の回数が多く受診したところ、病原性大腸菌O6/毒素原性大腸菌3+との事で、抗生物質と整腸剤を飲んでいました。２週間後の再検査で病原性は陰性になりましたが、１日3回位に落ち着いてきた便がまた5～6回に増えてきてしまいました。
それにより、もう少し様子を見ますかということで、予定していた予防接種が延期になってしまったのですが、そこで質問です。
ヒブ、肺炎球菌、ロタ、B型肝炎の２回目と、４種混合の1回目の予定だったのですが、２回目のワクチンに関しては１回目から１ヶ月以上も間が開いてしまうのですが、効き目が減ったりはしないのでしょうか？B型肝炎は4週間後に２回目、ヒブは27～56日の間にとありますがどちらもそれを過ぎてしまいます。きちんと回数を受ければ、抗体はきちんとつくのでしょうか？
もうひとつ、毒素原性大腸菌というのはやっぱり抗生物質を飲んだ方が良いのでしょうか？それとも、整腸剤だけで治ったりするのでしょうか？
今は整腸剤だけで様子を見ます。下痢なのか普通の便なのか、判断がつかなくてモヤモヤです。