陽性でも妊娠してない!?

20代/女性 - 2007/09/08

私は生理不順で基礎体温もｶﾞﾀｶﾞﾀなので排卵日や生理予定日が不明です。
現在思い当たる性交から2週間目で市販の妊娠検査薬ではうっすら陽性反応がありました。しかし病院では妊娠してない上に卵巣に水がたまっている、内膜が薄いと言われました。
この時期にお医者様に妊娠してないと言われたらあと一週間待っても妊娠の可能性はないでしょうか?

ちなみに現在前回最終月経から42日目で、最終月経前まで治療のためﾄﾘｷｭﾗｰ28を服用していましたが、今は飲んでいません。
宜しくお願い致します。