急性中耳炎？

乳幼児/男性 - 2019/03/07

2歳4ヶ月の男児です。
土日熱（39.2度）があり、休日診療所に行くもインフル、溶連菌共に陰性で原因わからず、結局日曜昼に熱が下がったのですが
また月曜日に熱（39.2度）が出てきたのでかかりつけの小児科へ行きました。インフル、アデノ共に陰性で原因わからず、耳も一応…と見てもらったら中耳炎でした。
抗生物質や整腸剤、解熱剤などをもらい、服用すると熱も下がったので安堵していました。
ところが1日と少し経った先程5時頃から寝れないようで、触ると熱いため計ると
また熱（39.1度）が出てきたようです。
様子を見て寝苦しそうなので処方されていたカロナールを飲ませました。（嫌がり水で溶いた物を二口程しか飲ませれてないですが半分以上は服用できたと思います）
もともと薬を飲み切る頃に耳鼻科受診をしようとは思っていたのですが
今日朝1番で耳鼻科にかかろうと思います。
中耳炎というのはこのように抗生物質を飲んでいても熱が上がったり下がったりするものなのでしょうか。抗生物質が合わない、というようなこともあるのか伺いたいです。
よろしくお願い致します。