熱の上がり下がりについて

乳幼児/男性 - 2008/07/05

1才10ヶ月の息子がいます。
6/28頃より咳をしていて、咳以外の症状は見られませんでした。

7/1、2とご飯、粉ﾐﾙｸを摂取するたびに嘔吐していました。
生後1ヶ月健診時に、喉頭軟化症が見つかり、嘔吐するものの、調子が良い時には水分やバナナなど摂取出来ていたので、様子を見ていました。

3日朝、体温38.3℃になり、病院に行き、点滴。その後、熱は37℃代に下がり、機嫌も良く、夕食もﾐﾙｸも摂取出来ていました。
夜、体温39.2℃、座薬使用し、36.8℃に。

4日朝、体温38.6℃、再受診、｢咳、脱水、急性胃腸炎｣との事で入院。
入院後、体温39.9℃まで上昇、座薬で37℃代に下げるものの、38℃代に上昇。

今日も、午前中体温37.8℃、午後40.7℃まで上昇し、座薬使用し37.6℃に。
血液検査では異常ないとの事です。
熱の上がり下がりが激しく心配です。
他に疑いのある病気などあるのでしょうか?