尿道炎の後遺症?と、との判断について。

尿道炎について質問です。当方20代男性です。
医師の診断により尿道炎と判断されました。菌は特定されませんでしたが、おそらく雑菌だろうとのことでした。そこでは、ガチフロ1週間。クラリスロマイシン1週間という投薬でほぼ、症状が消えたので、治療終了となりました。その後、どうも陰部の違和感が取りきれてなかったので、別の医者にかかったところ、ジスロマック250mg×4を処方され、現在10日経過し、その効果が切れたところです。しかし、いまだに違和感が取れない状況が続いています。仕事等で集中しているときは良いのですが、ふとした瞬間に違和感を感じます。
検査で、クラミジア等は検出されませんでした。お聞きしたいのは、この投薬の結果として菌は、ほぼ消えたと考えてよいのでしょうか?また、菌が消えても、違和感が残るということはあるのでしょうか?今後どのようにするのが良いのでしょうか?性行為を行っても良いのでしょうか?ご教授ください。よろしくお願い致します。

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