ピロリ菌の除菌薬について。

person40代/女性 -

胃カメラをしたのですが、胃とは別に大腸が調子が悪いです。（常時張ってる？ガスが溜まる、なんとなく痛い）パニック障害持ちで大腸内視鏡はハードルが高くてまだやってないのですが（できるかわからない）、ピロリ菌がいて、除菌薬を飲むことになった場合、大腸の調子が悪くても飲めるものなのでしょうか？
ちなみに2次除菌です。

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