ウイルス性結膜炎

40歳、女性です。
5日前、ウイルス性の結膜炎にかかりました。
夜、左目、目やにがたくさん出はじめて、まぶたがはれぼったくなり
次の日の朝は目の周りが赤くなり、まぶたが上も下も腫れてひどいものでした。
左目がハニワのような目になってしまいました。
微熱もあり、なんだか左側、頭から耳、肩にかけて違和感がありました。
内科で診察(血液検査あり)、血液検査、眼科で診察、耳鼻科で耳も見てもらいました。
結果何のウイルスかは検査しなかったのですがウイルス性結膜炎ということで目薬も
クラビットとフルメトロン2週類出てつけ始めたら腫れは
次の日にはおさまってきましたが目薬はまだ使っています。血液検査も耳鼻科も炎症はみられないとのことでした。

気になるのは
結膜炎になったあたりから肩こりのような違和感が続いています。
ときどき押したような痛み(というほどでもないですが)があり
おすと痛いところもありました。ウイルスのせいでしょうか?
そういうことはあるんでしょうか?
(子供のころから結膜炎にあまりなった記憶もないし、大人になってから結膜炎で眼科受診は初めてです)
今回のようにひどいのは初めてでした。

それと目薬はいつまでつかえばいいのでしょうか?

よろしくおねがいします。

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