黄色ブドウ球菌と抗生物質について

30代/女性 - 2009/07/06

10ヶ月になる息子の下痢便に粘血便が混じっていたため、便培養の結果、黄色ブドウ球菌+1がでました。小児科ではホスミシンドライシロップ400mg1回0.375gとラックビーRが処方されましたが、結果がでる前だったこと、抗生物質はなるべく飲ませたくないこと、別の小児科ではウィルス性胃腸炎と診断されミヤBMが処方されたこと、という理由から飲ませずにおりました(ミヤBMを服用)。
本日前述の検査結果がでたことから、便の再検査をと言われています(黄色ブドウ球菌がなくなったのを確認する必要があるとのこと)。
便は、粘血便が混じった下痢(1日3回魚の腐った臭い)から、緑色の下痢(1日4回酸っぱい臭い)、緑色の下痢(1日2回が2日)、黄土色のゆるめの便+夜緑色下痢、と回復しているように見えましたが、本日は黄土色便+夜大人親指大の粘便(魚の腐った臭い)となりました。
つきましては、今からでも抗生物質を5日間服用したほうがよいのでしょうか?整腸剤だけでは菌はなくなりませんか?やはり腸内から完全に菌をなくした方がよいのでしょうか?
どうぞよろしくお願いします。