ピロリ菌除菌と消炎鎮痛剤服用について

40代/女性 - 2010/02/01

整形外科で2週間ほど前から肩腱板炎の治療としてヒアルロン酸注射をしています。また、11月に腰椎ヘルニアと首もヘルニアがあることがわかり、それ以来電気治療もしています。
12月に3日間程鎮痛剤を飲んだら、胃痛が始まり飲むのをやめました。その後ずっと胃の調子が悪いため、1月中旬に胃カメラ検査をしたところ、ピロリ菌がおり慢性胃炎で胃がかなり荒れていることがわかりました。
同じ頃から肩が痛みだし、治療を始めていますが、胃が心配で 鎮痛剤を飲めず、メチコバールとミオナールのみを飲んでいます。
内科では、除菌するなら来なさいと言われており、何も処方されていません。
お聞きしたいのは、ピロリ菌除菌を今したほうがいいかです。
また、除菌中は他の薬は飲めませんか?
除菌後1か月は、胃薬を飲むようですが、そのときには他の薬や鎮痛剤を飲んでもいいのでしょうか?

もし除菌を後にするとしたら、(肩の治療は時間がかかるようなのですが)、その間 胃薬と鎮痛剤服用して 胃潰瘍などの心配はありませんか?
いろいろ重なっていてストレスが大きく、体重も落ち 体力も低下していてつらいです。
今の状態で、除菌が成功するかも心配ですが、何とかしたいです。
どうか至急回答をお願い致します。