10日前の性交より尿道に違和感があります

40代/男性 - 2018/06/08

5/28　初めての人（A)性交（ゴム無）　
　　　その夜、頻尿と尿道の違和感で寝付けず
5/29　引き続き尿道違和感ある為、尿検査（淋菌、クラ、マイコ、ウレア）実施
　　　→　結果どれも陰性
6/2　　Aに全ての検査をさせたところ、
　　　咽頭ウレア、単純ヘルペス、一般雑菌、HPVハイリスクで陽性

現在の症状
尿道の違和感、痛み、目の周りの違和感、脱力感
ウレアの尿検査及び咽頭検査を再度受けて結果を待ちながら、泌尿器科にて処方されたミノマイシン100を8日間飲んでいますが、改善せずむしろ痛みが増しているように感じます。質問したいのは、

１）性交翌日に検査をしたのが早過ぎて、正確に検査ができてないという事はあるのでしょうか？（かかり付けの泌尿器科は翌日でも検査は大丈夫と言ってましたが）

２）ウレアに感染している可能性が高いとみてますが、ミノマイシンを一週間飲んで全く効かないという事はあるのでしょうか？クスリをジスロマックSRに変えた方が良いでしょうか？

３）単純ヘルペス感染による尿道の違和感という可能性はあるのでしょうか？
　　特段外傷等は10日経った現在ありません。

４）一般細菌検査で自分も2つほど陽性が出てました（名前は聞いた事なく忘れましたが、医者は特段問題無く良くある事と言ってました）が、これが原因という可能性はあるのでしょうか？

寝不足と常にある違和感で正直参ってます。